申请互联网药品信息服务资格证，需遵循以下流程与准备相关材料：
一、确定申请主体资格
申请单位应为依法设立的企事业单位或者其他组织，且有能力对所提供的互联网药品信息服务承担法律责任。个人不能申请该资格证。
二、准备申请材料
1. 企业营业执照复印件（若为新办企业，提供工商行政管理部门出具的名称预核准通知书及相关材料）。营业执照需在有效期内，且经营范围应包含与药品信息服务相关或有开展此类业务的合理依据。
2. 网站域名注册的相关证书或者证明文件。网站域名应合法合规注册，且需注意网站中文名称的规范，除与主办单位名称相同外，不得随意冠以“中国”“中华”“全国”等字样；非取得药品招标代理机构资格证书的单位开办的网站，名称中不能有“电子商务”“药品招商”“药品招标”等特定内容。
3. 网站栏目设置说明。应详细阐述网站各个栏目的规划与定位，对于申请经营性互联网药品信息服务的网站，还需额外提供收费栏目及收费方式的说明，明确告知用户各项服务的收费标准与依据。
4. 网站对历史发布信息进行备份和查阅的相关管理制度及执行情况说明。需建立完善的信息管理系统，确保能随时对过往发布的药品信息进行有效备份与便捷查阅，管理制度应涵盖信息存储、检索、更新、安全保障等多方面内容，并说明实际执行的成效与记录方式。
5. （申请经营性互联网药品信息服务资格证时需提供）药品及医疗器械相关专业技术人员学历证明或者其专业技术资格证书复印件、网站负责人身份证复印件及简历。专业技术人员应具备相应的药品、医疗器械知识背景，网站负责人需有管理网站运营与药品信息审核发布的能力与经验。
6. 健全的网络与信息安全保障措施，包括网站安全保障制度、信息安全保密管理制度、用户信息安全管理制度等。要详细说明保障网站稳定运行、防止信息泄露与非法篡改的技术手段与管理机制，如防火墙设置、数据加密技术、用户权限管理等具体措施。
三、提交申请
将准备好的材料整理完备后，向所在地省级药品监督管理部门提交申请。部分地区可能支持线上申请平台提交，需按照平台要求上传电子材料；若采用线下提交，则需将纸质材料按规定顺序装订成册，提交至指定的受理窗口。
四、审核与审批
省级药品监督管理部门收到申请后，会对材料进行审核，可能会对申请单位进行实地考察，检查网站运营实际情况与申请材料的真实性、一致性。审核通过后，将发放互联网药品信息服务资格证书；若审核不通过，会书面告知申请单位不通过的原因及整改要求，申请单位可在整改后重新申请。