一、法律合规风险
互联网药品服务资格证失效意味着企业失去了合法从事相关药品服务业务的依据。一旦被监管部门发现并查处，企业将面临一系列法律责任。
二、业务中断影响
1）药品销售受阻：若资格证失效，企业在互联网平台上的药品销售业务必须立即停止。这将导致已有的订单无法正常处理，客户的信任度急剧下降，大量潜在客户流失。原本依赖线上渠道的药品销售业绩会大幅下滑，企业的市场份额被竞争对手迅速抢占。
2）服务提供受限：涉及药品相关的咨询、配送等服务也无法继续开展。例如，不能再为患者提供用药指导等专业服务，配送服务的中断会使已经购买药品等待收货的客户不满，进而引发大量投诉和纠纷，企业需要耗费大量精力去处理这些售后问题，且可能面临赔偿要求，进一步加重企业的财务负担。
三、信任危机产生
1）消费者信任丧失：消费者得知企业互联网药品服务资格证失效后，会对企业的专业性和可靠性产生极大怀疑。他们会担忧企业在药品采购、储存、销售等环节是否存在不规范操作，从而不敢再购买该企业的药品或使用其服务，企业长期积累的品牌形象和口碑毁于一旦。
2）合作伙伴信任受损：包括药品供应商、物流合作伙伴等在内的合作方，在得知资格证失效后，可能会暂停或终止与企业的合作关系。药品供应商可能担心货款回收问题或自身声誉受牵连而停止供货，物流合作伙伴可能因业务合法性问题而不再提供配送服务，这将打乱企业的供应链体系，使企业运营陷入困境。
四、重新获取难度大
重新申请互联网药品服务资格证面临诸多挑战。首先，需要重新整理和提交大量的申请材料，如企业营业执照、药品质量管理体系文件、专业人员资质证明等，材料准备过程繁琐且要求严格，任何一项材料不符合要求都可能导致申请被驳回。其次，在资格证失效期间，企业的经营状况、人员变动等可能导致部分条件难以满足重新申请的标准，例如人员资质不足或场地设施不符合最新规定等，这使得企业重新获得资格证的周期漫长且充满不确定性，在这段时间内企业只能处于停滞或转型的艰难抉择中。