一、确定申请主体资格
申请互联网药品信息服务资格证的主体需为依法设立的企事业单位或其他组织。个体工商户不能作为申请主体。同时，申请主体需有熟悉药品、医疗器械管理法律、法规和药品、医疗器械专业知识，或者依法经资格认定的药学、医疗器械技术人员。
二、准备申请材料
1. 企业营业执照复印件（需加盖公章），营业执照的经营范围应包含与互联网药品信息服务相关的内容或潜在关联业务表述。
2. 网站域名注册的相关证书或者证明文件，如域名注册证书，确保域名的注册所有者与申请主体一致，且域名未被用于违法违规活动。
3. 网站栏目设置说明，详细阐述网站计划设立的各个栏目，包括但不限于药品资讯、药品数据库、用药指导、药品新品推荐等板块的规划与定位，明确各栏目的信息来源与审核机制。
4. 网站对历史发布信息进行备份和查阅的相关管理制度及执行情况说明，例如数据备份的频率、存储方式、备份数据的保存期限以及如何确保在需要时能够快速查阅历史信息等内容，并提供过往信息备份与查阅的实际操作记录示例。
5. 药品及医疗器械相关专业技术人员学历证明或者其专业技术资格证书复印件、网站负责人身份证复印件及简历，专业技术人员所学专业应与药品或医疗器械领域紧密相关，网站负责人应具备一定的互联网运营管理经验与药品知识背景。
6. 健全的网络与信息安全保障措施，包括但不限于网络防火墙设置说明、数据加密技术方案、防止信息泄露与篡改的应急处理预案、用户信息保护政策等内容，确保网站运营过程中的信息安全与网络稳定。
7. 保证药品信息来源合法、真实、安全的管理措施、情况说明及相关证明，如与药品生产企业、药品监督管理部门官方数据库等合法信息源签订的信息获取协议或授权书，对所发布药品信息真实性审核的流程与标准文件等。
三、提交申请
将准备好的申请材料报送至所在地省级药品监督管理部门。申请材料应完整、规范、符合法定形式，确保一次性通过形式审查。部分地区支持线上提交申请材料，需在指定的药品监督管理部门官方网站的申请系统中按要求上传材料的扫描件或电子文档；若采用线下提交方式，则需将纸质材料按顺序装订成册，提交至省级药品监督管理部门的政务服务窗口。
四、审核环节
1. 形式审查：省级药品监督管理部门收到申请后，首先对申请材料的完整性、规范性和合法性进行形式审查。如发现材料存在缺失、错误或不符合要求的情况，将通过电话、邮件或系统反馈等方式通知申请主体在规定时间内补充或修正材料。
2. 实质审查：形式审查合格后，进入实质审查阶段。药品监督管理部门将对申请主体的资质条件、网站内容规划、信息安全保障措施、药品信息来源管理等方面进行全面审查。可能会对申请主体进行实地核查，检查实际运营情况是否与申请材料相符，包括办公场地、人员配备、技术设施等。同时，对网站进行测试，查看栏目设置是否合理、信息发布功能是否正常、信息安全保障措施是否有效落实等。
3. 审批决定：根据审查结果，省级药品监督管理部门作出审批决定。若申请符合条件，将颁发《互联网药品信息服务资格证书》；若不符合条件，将书面通知申请主体并说明理由，申请主体可在整改后重新申请。
五、领取证书
经审批通过获得证书颁发通知后，申请主体可按照通知要求的方式领取《互联网药品信息服务资格证书》。若采用线下领取方式，需携带有效身份证件及领取凭证前往指定地点领取；若为线上发放电子证书，可在指定网站或系统中下载、保存电子证书，电子证书与纸质证书具有同等法律效力。